按照国务院《关于深化改革严格土地管理的决定》（国发〔2004〕28号）的原则，2005年农业部制定了《关于加强农村集体经济组织征地补偿费监督管理指导工作的意见》（农经发〔2005〕1号），提出:
1、2005年以后新增土地补偿费的分配比例按照省级人民政府制定的标准分配，2004年以前的土地补偿费，没有分配的，仍归农村集体经济组织管理使用，原则上不得用于个人分配。
2、并特别强调，征地补偿费应主要用于被征地农民生产生活需要，严格按照专户存储、专账管理、专款专用的原则予以规范，留归被征地农民部分的土地补偿款归农民个人所有；留归农村集体经济组织的土地补偿款属农民集体资产，应当用于发展生产、增加积累等，不得用于发放干部报酬、支付招待费用等非生产性开支。安置补助费归失地农民所有，必须专款专用，不得挪作他用。
3、土地补偿费的分配、使用预算方案要经农村集体经济组织成员大会或成员代表大会批准，事后要将土地补偿费的实际开支、管理情况向农村集体经济组织成员大会或成员代表大会报告。
4、目前全国已有16个省（区、市）制定了土地补偿费分配管理办法，对土地补偿费的分配标准、使用范围、核算办法、审批程序作了相应规定，土地补偿费一般按不低于70%至80%的比例分配给农户，剩余部分留归村集体经济组织运营管理，用于发展壮大集体经济（如集体统一修建集市门面、标准厂房招租等物业经济）或村级公益事业。
根据2024年新版《土地管理法》的相关规定，土地征收补偿费用包括土地补偿费、安置补助费以及农村村民住宅、其他地上附着物和青苗等的补偿费用，并应安排被征地农民的社会保障费用。
农村土地征收分两种情况，一种情况是征收的是集体未承包出去的土地；另一种情况是征收的是已承包出去的土地。如果征收的是未承包出去的土地，那所有的补偿费都是归集体经济组织所有的，因《土地管理法》明确规定了农村土地归农民集体所有。但如果征收的是已承包出去的土地，那土地征收补偿费的分配方案就较复杂一些，不同种类的补偿费的补偿人群是不一样。
关于农村村民住宅、其他地上附着物和青苗的补偿费是归被征收人所有。这个不难理解，比如，征收了小李家的承包地，那这部分补偿款自然归小李家，因为地上的东西都是小李家的，大家也没什么意见。
而关于土地补偿费，大家就有点搞不清了。在农村，我们经常听到这样一句话：“这块地是我家的！”很多农民认为，这块地一直是自家在种，所以这块地自然就是自家的了。其实，我国土地分为国家所有和农民集体所有两种，农村土地是属于农民集体所有，像大家的承包地，农民作为承包方，只有承包经营权，并没有所有权，而土地补偿费是归土地所有者所有的，所以土地补偿费是归农民集体所有的。
关于土地补偿费的分配，也是争议最多的。根据《村民委员会组织法》的相关规定，征地补偿费的使用、分配方案等涉及村民利益的事项，是需经村民星空讨论决定方可办理的。
土地补偿费常见的使用、分配方案：
1、按集体经济组织成员人数平均分配，也就是按人口平均分配。只要户口在集体经济组织的成员，包括户口未迁出的出嫁女都是可以分到一份土地补偿费的。
2、按集体经济组织户数平均分配，也就是按户平均分配。有些地方，因每家每户的人口也差不多，就采取了这种按户分配的方法。虽然对于个别人数较多的家庭，感觉是吃了亏，但如果集体大部分户数都同意这种分配方法的话，个别家庭也只能接受。
3、土地补偿费归被征地农户。像山西就规定，已确权确地到户的土地被部分征收或征用的，其土地补偿费以不低于80%的比例支付给被征地农户；其余20%留给村集体经济组织。也就是说，山西在分土地补偿费时，大部分会分给被征地农户，剩下的少部分留给集体经济组织。
4、以上3种方案都是把土地补偿费分到个人了，但土地补偿费还有一种也算普遍的使用方案，那就是土地补偿费不分配给个人，留着给集体公用，比如村里修路、建祠堂等等。
依照我国土地制度，农村土地所有权归集体所有，村委会或村民小组代表集体行使对集体财产的权利承担集体财产产生的相应义务；而村民以承包的形式获得土地的使用权。但是作为农民安身立命的土地在面临征收时，该如何处理好使用权与所有权的关系即村民和村委会的关系，关系到每个被征地农户的切身利益。
我国《土地管理法》第四十七明确规定征收土地的，按照被征收土地的原用途给予补偿。其中征地补偿费用包括土地补偿费、安置补助费及地上附着物和青苗补偿费。
土地补偿费是指因国家征收土地对土地所有者和土地使用者因对土地的投入和收益造成损失的补偿。安置补助费是指为安置以土地为主要生产资料并取得生活来源的农业人口的生活，国家给予的补助费用。地上附着物和青苗补偿费是指，征收土地时由征收方支付给地上附着物和青苗所有权人就地上物损失的补偿费用。
《土地管理法实施条例》星空十六条明确规定，土地补偿费归农村集体经济组织所有；地上附着物及青苗补偿费归地上附着物及青苗的所有者所有。征收土地的安置补助费必须专款专用，不得挪作他用。需要安置的人员由农村集体经济组织安置的，安置补助费支付给农村集体经济组织，由农村集体经济组织管理和使用；由其他单位安置的，安置补助费支付给安置单位；不需要统一安置的，安置补助费发放给被安置人员个人或者征得被安置人员同意后用于支付被安置人员的保险费用。
此外，依据最高人民法院《关于审理涉及农村土地承包纠纷案件适用法律问题的解释》星空十二条的规定，承包方已将土地承包经营权以转包、出租等方式流转给第三人的，除当事人另有约定外，青苗补偿费归实际投入人所有，地上附着物补偿费归附着物所有人所有。
依据此规定可知，征地补偿款星空地补偿费直接拨付给村委会或村民小组，村委会或村民小组可以依照法律规定的民主议定程序，决定在本集体经济组织内部分配已经收到的土地补偿费，而村民作为村委会或村民小组的一员仍享有分配该笔费用的权利。
法律分析：集体土地被征用，土地补偿款是补偿给集体平均分配。按照土地补偿费主要用于被征地农户的原则，土地补偿费应在农村集体经济组织内部合理分配。具体分配办法由省级人民政府制定。
法律依据：《中华人民共和国土地管理法》第四十七条 国家征收土地的，依照法定程序批准后，由县级以上地方人民政府予以公告并组织实施。县级以上地方人民政府拟申请征收土地的，应当开展拟征收土地现状调查和社会稳定风险评估，并将征收范围、土地现状、征收目的、补偿标准、安置方式和社会保障等在拟征收土地所在的乡（镇）和村、村民小组范围内公告至少三十日，听取被征地的农村集体经济组织及其成员、村民委员会和其他利害关系人的意见。多数被征地的农村集体经济组织成员认为征地补偿安置方案不符合法律、法规规定的，县级以上地方人民政府应当组织召开听证会，并根据法律、法规的规定和听证会情况修改方案。拟征收土地的所有权人、使用权人应当在公告规定期限内，持不动产权属证明材料办理补偿登记。县级以上地方人民政府应当组织有关部门测算并落实有关费用，保证足额到位，与拟征收土地的所有权人、使用权人就补偿、安置等签订协议；个别确实难以达成协议的，应当在申请征收土地时如实说明。相关前期工作完成后，县级以上地方人民政府方可申请征收土地。
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